すべての「何」に「どこ」を見出す

組織サンプルにおける細胞とその位置の関係は疾患病理を理解する上で重要です。空間的遺伝子発現解析（トランスクリプトミクス）は画期的なテクノロジーで、組織サンプルにおけるい遺伝子活性を測定し、その活動がどこで発生しているのかをマップすることができます。この技術は既に新しい発見を生み出しており、研究者による生物学プロセスと疾患の理解に役立っています。

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空間キャプチャー技術により空間的発見を促進

空間キャプチャー技術は、空間的にバーコード化された、mRNA結合オリゴヌクレオチドを使用することで、Visium 空間的プラットフォームを可能にします。mRNA分子が空間バーコードを取得する方法には2つの方法があります。

新鮮な凍結組織では、組織を固定して浸透させることにより、放出されたRNAは隣接するキャプチャープローブに結合し、遺伝子の発現情報を取得します。

FFPE組織では、組織を透過させることでライゲーションされたプローブペアをスライド上に放出し、隣接するキャプチャーオリゴに結合することで発現情報を取得します。タンパク質をコードする各遺伝子に特異的なプローブのペアは、その遺伝子ターゲットにハイブリダイズした後、互いにライゲーションされます。その後プローブペアを伸長して、空間バーコード付きの相補鎖を組み込みながら、シーケンスライブラリーを作成します。

組織微小環境における状況を遺伝子発現で探索

空間的遺伝子発現テクノロジーの革新は、研究者に包括的かつ形態学的な細胞の理解をもたらしました。この発表では、10x Genomicsのサイエンティストが画期的なテクノロジーの改良とユーザーによる素晴らしいアプリケーションを学べます。