一个细胞，两种读数
同时检测同一细胞中的mRNA和染色质可及性。
定义基因调控
发现新的基因调控相互作用。
单细胞分辨率
以单细胞的精确性检测稀有细胞群体。
灵活且可扩展
分析每个样本中数百个至数万个细胞。
简化的数据分析
通过轻松易用的软件同时探索基因表达和染色质可及性。
高效的实验室流程
从样本到可立即测序的文库只需两天。
发现隐藏的信息
以单细胞分辨率对转录组和表观基因组进行多组学分析，将改变您对生物学的理解。每个细胞的两种读数可增强您对细胞类型和状态的鉴定，并帮助您深入了解背后的基因调控机制。立即使用单细胞多组学ATAC + 基因表达，提升您的探索能力。
您可以实现哪些探索
更深入地鉴定细胞类型和状态
通过表观基因组和基因表达谱的综合分析来鉴定复杂的细胞群体，并捕获细胞异质性，从而发现隐藏的信息。基因表达标志物可帮助您更轻松地解释表观遗传图谱。
发现新的基因调控相互作用
将调控元件的发现与基因表达相结合，探索驱动细胞分化、发育和疾病的基因调控相互作用。
充分利用您的宝贵样本
从同一细胞中获得转录组和开放染色质信息，让您从有限样本中得到尽可能多的发现。
探索疾病的复杂性
了解疾病中的基因调控网络如何被破坏。询问表观遗传重塑和治疗耐药的机制。
经过验证的结果
经过验证的结果
资源
查找有关Chromium单细胞多组学ATAC + 基因表达的最新资源
Identification of a tumor–specific gene regulatory network in human B-cell lymphoma
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Data Spotlight, 10x Genomics
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Grant Application Resources for Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
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Grant Application Resources, 10x Genomics
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Massively parallel simultaneous profiling of the transcriptomic and epigenomic landscape at single cell resolution
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Poster, 10x Genomics
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完整的解决方案
Chromium单细胞多组学ATAC + 基因表达试剂
使用我们的试剂盒，您可以同时检测同一细胞的基因表达和开放染色质区域，并生成可立即测序的NGS文库。
数据分析和可视化软件
Cell Ranger ARC数据分析流程以及Loupe Browser数据可视化软件。
世界级的技术支持和客户支持
您可以通过电话或电子邮件联系我们的专家支持团队。
工作流程
- 1
- 2
文库构建
使用我们的试剂盒和Chromium Controller仪器构建带有10x 条形码的单细胞基因表达和ATAC配对文库。首先对细胞核进行大规模转座处理，然后通过Chromium Controller把单个细胞核封装在带有10x条形码的凝胶珠（Gel Bead）内。在每个纳升级液滴内，mRNA和转座的DNA片段均用10x条形码标记，而每个条形码序列代表同一个细胞。
资源 - 4
数据分析
Cell Ranger ARC分析软件可生成每个细胞的开放染色质和基因表达谱，鉴定图谱相似的细胞簇，并计算开放染色质峰与基因表达之间的联系。
分析结果输出
输出结果包括质控信息和文件，这些文件可轻松用于Loupe Browser可视化软件或第三方R工具及Python工具的进一步分析。
资源 - 5
数据可视化
利用Loupe Browser可视化软件，您可以交互式地探索实验结果，比较不同细胞类型和状态之间的染色质可及性和基因表达，并研究开放染色质峰和基因表达之间的联系。
只有生物信息学家才能使用Loupe吗？
Loupe是点选式软件，任何人都能轻松下载和使用。
资源
常见问题
它能够对单细胞的转录组（使用3’基因表达）和表观基因组（使用ATAC-seq）进行同时分析，以帮助您了解不同类型细胞之间的基因如何表达和调控。
在使用单细胞多组学ATAC + 基因表达测试的样本类型中，当起始样本为细胞核时，ATAC和基因表达的表现与相应的10x Genomics单独流程（Chromium单细胞ATAC或Chromium单细胞基因表达）相当。
目前，Feature Barcode技术与单细胞多组学ATAC + 基因表达不兼容。
需要细胞核悬液。从新鲜和冻存细胞、新鲜组织和冷冻组织中可以获得高质量的细胞核悬液。此分析已针对人类和小鼠样本进行优化。
是的，单细胞ATAC和单细胞基因表达数据的文件格式与单细胞多组学ATAC + 基因表达兼容，可利用Seurat等第三方工具进行整合。
