帮助我们塑造数据可视化的未来
您是否在单细胞或空间数据分析和可视化中使用过Loupe Browser？您未来有计划使用它吗？请填写这份用时约5分钟的调研问卷，与我们分享您的反馈和对功能愿望清单的想法。
- 告诉我们您想在Loupe Browser上看到什么功能。
多维度分析
分析样本内和样本间的不同分子读数，推动科学探索。
轻点鼠标即可
通过用户友好的界面来探索数据，并加深您对生物学的理解。
专家支持
全面的软件视频和教程等工具可加速您的分析。
单细胞基因表达
鉴定细胞异质性
探索复杂生物学中的细胞组成，发现新的细胞亚群，并开展比较分析，以揭示样本间细胞群体的变化。
研究基因表达模式
对不同细胞簇的表达图谱和差异表达基因进行可视化。
探索细胞类型组成
分析和调整细胞簇，以便确定新颖或稀有的细胞类型。
获得多组学信息
通过单细胞基因表达和蛋白质表达数据来全面分析新的细胞状态。
比较样本间差异
揭示表达模式、细胞类型及其丰度的差异。
单细胞免疫分析
获得免疫反应的多组学视图
以交互的方式探索多个样本和细胞类型间的免疫复杂性，从而了解基因使用情况、组库多样性和克隆扩增等。
探索免疫组库
对于单细胞免疫分析产品，我们额外提供可视化软件Loupe V(D)J Browser，以实现更深度的数据分析。
- 评估克隆型频率、V(D)J基因使用情况和配对分布，以鉴定T细胞和B细胞组库。
- 观察和比较各个细胞类型和样本之间的主要指标。
单细胞多组学ATAC + 基因表达
统一表观基因组和转录组的信息
- 揭示多组学标志物，以便划分细胞类型。
- 通过同时测定同一单细胞的染色质可接近性和基因表达来完善细胞类型和状态。
- 研究开放染色质峰与基因表达之间的基因调控关联。
空间基因表达
其他支持的分析和可视化
Loupe Browser实现了多个单细胞应用的数据分析
表观遗传学
通过Loupe Browser查看单细胞ATAC数据，可开展染色质可接近性的差异分析，寻找富含感兴趣的转录因子motif的细胞簇，并比较不同样本的开放染色质图谱。
免疫受体映射
采用单细胞免疫受体映射来筛选B细胞或T细胞的多个抗原或表位的结合特异性。获得相应的全长配对的受体序列，用于下游的表达和功能检测。
多组学细胞技术
观察和解释多组学细胞术实验的结果，并通过细胞表面蛋白和基因表达读数来更可靠地鉴定细胞类型。
CRISPR筛选
观察单细胞CRISPR筛选的数据，以便鉴定向导靶点的CRISPR扰动表型并评估敲除的效果。
常见问题
Loupe V(D)J Browser是一款单独的可视化软件应用程序，具有分析单细胞免疫分析产品的TCR和BCR克隆型信息的特定功能。
Loupe Browser是一款点击式软件，让所有人都能分析10x Genomics的数据，而无论其在生物信息学方面的知识水平如何。
Loupe Browser使用.loupe文件来实现10x Genomics数据的可视化。.loupe文件是在运行兼容的10x Genomics分析软件应用程序时产生的，这些应用程序将原始数据转化成标准文件格式，以便用于下游解释。在您拥有分析软件的输出文件之后，您可以下载最新版本的Loupe Browser，并开始数据分析。
下列资源可帮助您使用Loupe Browser来分析数据：
- 探索示例数据集 - https://10xgenomics.com/cn/resources/datasets/
- 在支持页面上查找每个产品特定的Loupe文档和教程
Loupe Browser是免费提供的，让所有人都能分析10x Genomics的数据。